Ako Vaša dijete pati od alergije na hranu, to je zbog preosjetljivosti njegovog imunološkog sustava. Normalno, naš imunološki sustav razlikuje "bezopasno" od "štetnog". Ako osoba s normalnim imunološkim sustavom jede, na primjer, orašaste plodove, to joj obično neće uzrokovati probleme. U slučaju alergije, tijelo reagira pretjeranom alergijskom reakcijom na hranu koja je zapravo bezopasna.
Nasuprot tome, intolerancija nema nikakve veze s imunološkim sustavom. Umjesto toga, intolerancija znači da probavni sustav nije u stanju probaviti ili apsorbirati unesene sastojke hrane. Hrana nije pravilno obrađena, zbog čega se mogu javiti neugodni simptomi poput nadutosti ili proljeva.
Na primjer, laktoza se ne može razgraditi ako postoji nedostatak određenog probavnog enzima (laktaze) te stoga neprobavljena ulazi u debelo crijevo i služi kao hrana crijevnim bakterijama koje tijekom prerade laktoze stvaraju plinove koji mogu dovesti do nadutosti.